公司扣除农民工的个人所得税合法吗？

公司扣除农民工的个人所得税是合法的。从法律角度看，个人所得税是每位公民应尽的法定义务，无论其职业身份如何。公司作为代扣代缴义务人，有权在发放工资时扣除员工应缴纳的个人所得税。若公司未依法代扣代缴，可能面临税务部门的处罚。当发现公司扣除的税额远超应缴税额，或未提供明确的扣税明细时，表明问题可能比较严重，应及时咨询专业人士。
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从法律角度，处理公司扣除个人所得税的问题，常见方式有：一是核实扣税明细，确保公司扣除的税额与税务部门规定的应缴税额相符；二是与公司财务部门沟通，了解扣税依据和流程；三是如存在争议，可向税务部门投诉或咨询专业律师寻求法律救济。选择处理方式时，应优先考虑核实扣税明细和与公司沟通，若无法解决再考虑投诉或法律途径。
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从法律角度，针对不同情况，处理公司扣除个人所得税问题的具体操作如下：1.若对公司扣除的税额有疑问，首先应要求公司提供详细的扣税明细，包括扣除项目、税率及计算方法等。2.如发现公司扣除的税额有误，应与公司财务部门进行沟通，提供个人收入证明及相关税务文件，要求重新核算税额。3.若公司拒绝更正或沟通无果，可向当地税务部门投诉，并提供相关证据材料，请求税务部门介入调查。4.在必要时，可寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护个人合法权益，包括但不限于提起行政诉讼或民事诉讼。